gnome-terminal støtter tre fargeplaner: Linux fargeplanen, fargeplanen til farge Xterm og fargeplanen til rxvt. Disse definerer intensiteten og fargene for de seksten ANSI fargekombinasjonene som er støttet av terminalen.
Når ingen farger er spesifisert, kan programmet bruke et antall farger for standard forgrunn og bakgrunnsfarger. Hvit og sort i den følgende beskrivelsen kobles til de fargene som defineres av fargeplanen for hvit og sort.
Standardmodusene som støttes er: hvit på sort, sort på hvit, grønn på sort og sort på lys gul.
I tillegg til standard fargekombinasjonene for forgrunn og bakgrunn kan brukeren velge sine egne forgrunns- og bakgrunnsfarger fra boksen egenskaper.
I tillegg kan brukeren dra en farge fra enhver GNOME fargevelger eller fargekilde og slippe den i terminalen. Hvis brukeren slipper fargen på et hvitt område vil den sette bakgrunnen, hvis brukeren slipper fargen på en celle som inneholder et tegn vil dette endre forgrunnnen.