############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.23-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data CTCF ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘CTCF/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘CTCF’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package (it is needed to build vignettes) * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘CTCF.Rmd’ using rmarkdown Quitting from CTCF.Rmd:184-193 [unnamed-chunk-9] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: ! 'filter' is not an exported object from 'namespace:plyranges' --- Backtrace: ▆ 1. └─CTCF_hg38 %>% plyranges::filter(pvalue < 1e-06) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'CTCF.Rmd' failed with diagnostics: 'filter' is not an exported object from 'namespace:plyranges' --- failed re-building ‘CTCF.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘CTCF.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted