############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/bbs-3.22-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data Single.mTEC.Transcriptomes ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘Single.mTEC.Transcriptomes/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘Single.mTEC.Transcriptomes’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘mTECs.Rnw’ using knitr Quitting from mTECs.Rnw:2713-2758 [Figure_Supp10_unrelated] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error in `keepSeqlevels()`: ! could not find function "keepSeqlevels" --- Backtrace: x 1. \-global makePlotForRegion(dn2, left = 1000, right = 1500, colClusterNumber = clusterNumber) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'mTECs.Rnw' failed with diagnostics: could not find function "keepSeqlevels" --- failed re-building ‘mTECs.Rnw’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘mTECs.Rnw’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted