mrc3Dto2D

3D画像を2D画像にする


オプション一覧
オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル設定 NULL
-o 必須 出力ファイル設定 NULL
-Rot1 選択 最初の回転 0.0 360.0 10
-Rot2 選択 2度目の回転 0.0 360.0 10
-Rot3 選択 最後の回転 0.0 360.0 10
-EulerMode 選択 オイラー角の回転モード設定 ZOYS
-InterpolationMode 選択 展開モード 1
-AreaMode 選択 エリアモード:投影をする全空間の形
0:立方体 1:球
0
-m 選択 モード 0
-h 選択 ヘルプを表示  


モードの詳細
モード 説明
0 投影像の数はそのまま
1 回転角を減少させる
nRot3=1とRot2の軸が2D画像平面に垂直であるなら、投影像の数を減少させることができる

-InterpolationModeの詳細
モード 説明
0 最短距離法
1 線形補間法
2 3次補間法
3 多項式法


オプション-EAのRotModeの設定の詳細
一桁目: どの軸から回転を始めるか設定
二桁目: 回転軸の順番を設定1
O…Z→Y→Xの順に回転軸を変更する
E…Z→X→Yの順に回転軸を変更する
三桁目: 回転軸の順番の設定2
Y…順番を維持する
N…順番を逆順にする
四桁目: 回転方法を設定
Y…物体そのものをまわす
D…座標を移動させる

******実行例******

------入力ファイルの画像------
121p.png(17496 byte)
pdbInfoでみた入力ファイルの詳細
121p-Info.png(2313 byte)

pdb2mrcで3Dのmrcファイルに変更
xy平面 yz平面
121p.mrc.png(10220 byte) 121p.mrc-2.png(9814 byte)


------オプション必須項目のみの場合------
121p.no2.out-m0.png(10799 byte)

最小
最大
平均値
標準偏差
標準誤差

0
0.186008
0.00302756
0.0128325
7.12722e-07



------オプション -Rot1 -Rot2 -Rot3------
すべてRot 0 180 30で設定
xy平面 yz平面
121p.no2.out-Rot-2.png(5660 byte) 121p.no2.out-Rot-1.png(15173 byte)

最小
最大
平均値
標準偏差
標準誤差

0
0.175
0.00302838
0.0129759
8.75794e-06



------オプション -EulerMode------
Rot1,Rot2,Rot3のすべて 0 180 30で、EulerModeをXOYSで設定
xy平面 yz平面
121p.no2.out-Rot-EY2.png(6972 byte) 121p.no2.out-Rot-EY.png(13119 byte)

最小
最大
平均値
標準偏差
標準誤差

0
0.175
0.00303008
0.0129694
8.75351e-06



------オプション -InterpolationMode------
InterpolationMode:0
121p.no2.out-In0.png(9041 byte)

最小
最大
平均値
標準偏差
標準誤差

0
0.2125
0.00301082
0.0137354
9.27052e-06

InterpolationMode:1

最小
最大
平均値
標準偏差
標準誤差

0
0.175
0.00302838
0.0129759
8.75794e-06

InterpolationMode:2
121p.no2.out-In2.png(8789 byte)

最小
最大
平均値
標準偏差
標準誤差

-0.0325619
0.213961
0.00302793
0.0137247
9.26332e-06

InterpolationMode:3
121p.no2.out-In3.png(7742 byte)

最小
最大
平均値
標準偏差
標準誤差

-5.4667
184.383
3.28548
13.7206
0.00926055