メインメニューの表示→文章モードから任意の項目を選ぶことでシンタックスハイライト行うことが出来ます
注1 ユーザーごとに設定した場合はVista以降なら[ユーザ名]\AppData\Roaming\FooEditorに、XPなら[ユーザー名]\Application Data\FooEditorに放り込んでください
注2 同じファイルがそれぞれのフォルダーにある場合、ユーザー側のファイルが優先されます